请问这个编码加轨道该如何做

对，自己编码加轨道就可以。:)

这个貌似没有现成套件吧，可能需要自己重新写。视频容器用MKV应该可以，MKV这个视频容器中可以有多个轨道，一条轨道存储视频，一条轨道存储音频，一条轨道存储GPS数据。